Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TM4SF18Q96CE8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms