Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms