Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF12Q8WXF0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms