Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms