Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SFRP1Q8N474 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SFRP1Q8N474 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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