Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
WDR53Q7Z5U6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms