Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms