Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAL3Q7RTP6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms