Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMBQ6PCB8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms