Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC102BQ68D86 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC102BQ68D86 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms