Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGAP9Q5VTM2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms