Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP170Q5SW79 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms