Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms