Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms