Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q499Y3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q499Y3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q499Y3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q499Y3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q499Y3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q499Y3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q499Y3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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