Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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