Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RTN1Q16799 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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