Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRF1Q16656 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms