Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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