Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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