Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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