Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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EFNB3Q15768 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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