Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms