Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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UBE3CQ15386 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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