Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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