Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms