Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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SHPRHQ149N8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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SHPRHQ149N8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SHPRHQ149N8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SHPRHQ149N8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SHPRHQ149N8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SHPRHQ149N8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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