Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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