Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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