Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMC2Q13753 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms