Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMB3Q13751 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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