Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms