Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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