Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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BFSP2Q13515 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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