Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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TCIRG1Q13488 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TCIRG1Q13488 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TCIRG1Q13488 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TCIRG1Q13488 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TCIRG1Q13488 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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