Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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