Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CHAF1BQ13112 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CHAF1BQ13112 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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