Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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