Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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