Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms