Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms