Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms