Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms