Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms