Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPARDQ03181 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARDQ03181 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms