Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF8Q02556 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF8Q02556 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms