Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms