Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms