Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms