Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP1S1P61966 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms